两篇Nature发现内含子的新作用帮
提示:欢迎点击上方「PaperRss」↑ 一直以来,科学家们对许多真核蛋白编码基因中散布的没有明显生物学功能的非编码DNA片段到底起什么作用感到困惑。这些被称为内含子的序列通常在转录和翻译的时候,从它们的原始序列剪接出来并在蛋白质产生之前迅速被破坏。 1月16日Nature杂志上发表的两项最新研究意外发现了内含子的新作用(至少在酵母中)——许多内含子在剪接后很长一段时间都滞留在细胞中,并且在压力条件下调节细胞生长过程中扮演了重要角色。 伦敦大学学院的遗传学家JürgB?hler(未参与该项研究)评论说:“这让人非常惊讶和兴奋,像内含子这种通常被认为是废物的东西在饥饿等某些生理条件下,竟然可以起到如此巨大的调节作用。” 自年内含子被发现以来,针对它们为什么存在,科学家们已经提出了几种理论,例如,内含子可能可以通过延迟将DNA转化为蛋白质所需的时间,发挥调节基因表达的作用。内含子还帮助选择性剪接,这是一种允许核糖体从单个基因组装多种不同蛋白质的过程。但是,人们还是认为内含子没有多大用处,加拿大谢布克大学的遗传学家SherifAbouElela说。 在最新两项研究中,Elela与Whitehead研究所的DavidBartel两个研究组分别通过不同的方法独立发现了内含子在酵母中的功能。 生物学家Bartel领导的研究组是偶然获得了这一发现:在一项无关的研究中,Bartel实验室的一位博士生JeffreyMorgan通过酵母细胞RNA测序发现了许多内含子片段,而这些细胞正处于悬浮培养,细胞生长减少的阶段,研究人员认为这表明内含子在细胞中积累,而不是降解。 经过进一步调查,研究小组发现了有34个内含子(大约占据11%的酵母内含子)看起来非常稳定并且在剪接体复合物周围徘徊,“看起来它们仍然与这些剪接体组件相关联,这能防止它们降解,”Bartel解释说,当时他们还不确定这是为什么。 为了评估这些异常稳定的内含子的潜在生物学作用,研究小组利用CRISPR从酵母基因组中删除了几个内含子,比较突变细胞与正常细胞的生长。在营养资源丰富的时候,与野生型细胞相比,突变细胞更加蓬勃生长;而当资源稀缺时,野生型细胞还能繁盛生长,但突变细胞不能,由此研究人员认为这些稳定的内含子可以帮助细胞减缓繁殖条件下的生长,同时帮助细胞在饥饿期间持续更长时间。 由Elela领导的另一个研究小组则系统地构建了一个由个酵母菌株组成的文库,其中每个菌株都有一个不同的内含子缺失(这源自该团队于年启动的一个项目)。 缺失内含子在营养不良的环境中会阻碍细胞生长,这与Bartel的结果类似,但在资源充足时对细胞几乎没有影响。Elela的研究小组发现,酵母基因组中的许多内含子(大约90%)在被剔除时会发生这种效应。 由于尚不清楚内含子如何在饥饿条件下促进细胞存活发,两个小组都提出了一种机制,认为这些内含子可以使剪接体杂乱,防止它剪接新转录的内含子。在营养稀缺的环境中,这将有利于细胞的存活,因为它可以防止在没有足够资源的环境中尝试生长,浪费能量。 Elela小组的其他实验表明,在饥饿细胞中,内含子抑制蛋白质生成所必需的核糖体蛋白基因的表达。他认为这表明内含子允许更少的这些基因被剪接和翻译,最终减缓细胞代谢,减少能量消耗,帮助细胞存活更长时间。 另一方面,在繁殖条件下,减缓细胞代谢将是有害的,基于其他实验,研究人员提出了一个模型,其中TORC1途径(一种控制酵母生长以响应营养物质的关键信号级联)启动营养贫乏环境中内含子的积累。最终,这将有助于细胞在压力下更好地应对,确保细胞不会消耗宝贵的资源,“富日子里的垃圾是穷日子里的宝贝,”Elela说。 对于B?hler来说,这个想法很有意义。他指出TORC1途径可以调节核糖体蛋白的产生,但具有不同的机制,因此内含子积累“似乎可以说是处于剪接水平的额外控制方式”。 原文标题: J.T.Morganetal.,“Excisedlinearintronsregulategrowthinyeast,”Nature,doi:10./s---1,. J.Parenteauetal.,“Intronsaremediatorsofcellresponsetostarvation,”Nature,doi:10./s---7,. 文章内容转载自网络,如有侵权请联系PaperRSS小编删除。 往期文章精彩推荐:(直接点击浏览) 重磅分享 苹果、win7下的endnoteX9文献管理软件。亲测都可以下载! 全球选才!西湖大学发布首次学术人才招聘通知 爱思唯尔发布2年高被引学者榜单 Science:“垃圾DNA”不“垃圾” 研究一根黄瓜摘获两项大奖 NatCommun.:用CRISPR精确遗传控制害虫 国家科学技术奖第一完成单位盘点:清华第一,上海交大第二 41岁当选院士的他,站上国家最高领奖台 同济大学研究生受导师“压迫”坠楼?校方回应了 清华90后博士万蕊雪在《science》发7篇论文,获全球青年科学家奖 狼来了!临沂大学近三百硕士教职工“被弃”规划后年博士达五成 揭秘:北交大实验室爆炸事件中的垃圾渗滤液到底有多危险? 考研“乌龙”接二连三,高校别挥霍“自命题权” 读文|BBC、CNN相继报道,最新研究发现:雾霾会进入大脑 斯坦福大学迎来首位华裔女院长 我在西湖大学读博士这半年 博士期间8篇一作CNS!又荣获《Science》2“青年科学家奖” 中国诞生世界首例基因编辑婴儿,但科学家们都怒了 “80后”女专家,升正厅 PNAS论文引争议,中日学者撰文质疑 Nature重磅:吃点“糖”,肿瘤就停止生长了 名青年才俊!2年国家杰青名单正式尘埃落定 农学专业回暖,高校何以站稳脚跟 国外高校博士后的苦与乐 累计发表19篇SCI论文,浙大女博士用篇文献“刷”出研究方向! 腾讯的“科学探索奖”:改变什么? 十位高颜值,高智商的最美女科学家学霸!谁说女子不如男? 喜报 中国博士后科学基金第64批面上资助人员公示:位博士后受资助 年薪30万招聘中学老师,50位清华北大硕士博士博士后前去应聘 西湖大学招募学术人才份简历选出39位面试 点赞:长江学者开评,杰青回避! 无模板CRISPR-CAS9基因编辑! DavidLiu最新《Nature》: 欧盟新规“精准打击”基因编辑研究 UCAS 中国科学院大学重庆学院成立 颜宁:当科学家是幸福的 中国科学家10月参与发表多篇Nature文章 -中国大陆大学SCI数量趋势 两位著名女科学家Science发布重大成果:打开大脑这个“黑匣子” 教育部部长陈宝生:高校教师不管荣誉多高老师是第一身份教书是第一工作上课是第一责任 2年国家杰出青年终评结果出炉:人候选名单仅1人未通过 博士一年的收入能有多少?建议大学生和家长收藏! “教授”梁莹被揭穿,然而是谁纵容了她? 影响因子.的“神刊”:预防癌症,这件事“最重要”! 喜讯!科技部年创新人才推进计划入选名单公布 “女神”最新Science!带来最小版CRISPR 女教授跟生活的死磕,毕业后我才知道:我有个好导师 为什么哈佛医学院心脏病专家PieroAnversa能连续17年学术造假,却不被发现? 博士一篇论文获奖50万元,作者本科出自普通二本 新版国自然最完整资料出炉,13位基金专家最新整理,限时免费! 九个月内6家高校相继成立农学院,为何由冷转热? 59岁女副教授退休前撞上了诺奖 2年诺贝尔化学奖为什么授予“酶定向进化”和“多肽和抗体噬菌体展示技术”? 《瞭望》刊文:科研导向不科学阻碍重大原创性成果产生 新晋诺奖得主年来复旦领奖却被质疑,引发轩然大波,听听他们当时的获奖感言 2诺贝尔奖:癌症免疫疗法带来了“革命” 开讲啦,一作!谢晓亮团队Science文章解读:带你进入单细胞基因组的三维世界 科技部开展专项行动为科研人员减负 西湖大学即将开学首批学生亮相来看记者深度探访 单染色体酵母论文第一作者选择申请海外博士后 8月17日!2年度2年国家自然科学基金公布在即 中国大学毕业生薪酬水平排行榜TOP Natureplants:基因组编辑技术克服土豆育种自交不亲和难题 三部门:适度扩大博士研究生规模大力培养急缺人才 北大浙大等高校师生在桂林开会遭遇集体性食物中毒92人入院治疗 30所即将从学院改名为大学的学校,都有哪些? 多地高校学费调整,你的学费变了吗? 到目前为止,我国授予博士学位的毕业生总数多少人? 为何众多博士会选择待遇更低的高校? 42所一流大学建设高校国自基金常规三大项位次表现(-18) 重磅 西安交通大学首次以第一单位登上Science,顺利组装罂粟基因组图谱 博士毕业带着宝宝去应聘 教育部2年创新人才推进计划推荐名单公示 “论文产量最多”的大学排名,硬邦邦的实力啊 中山大学将成立农学院!但这不是第一次 百万美元“未来科学大奖”揭晓:袁隆平等三人获生命科学奖 世纪判决:张锋团队在CRISPR专利案中胜诉,裁定称双方无专利冲突 中科院植物学专业理学博士教中学:学生求知的眼神更加吸引我 韩春雨自称“代笔博士论文收费七千”,还欲组织学生买卖论文 伪科学:针灸和量子纠缠能扯一起!针灸原来有这么强的科学背景 饶毅致信美国科技官员:科学家应该有脊梁 “论文大神”董鹏5年发表篇文章,谁与争锋? 年,请别在《自然》《科学》发文…… 国家自然科学基金最新政策,附申请指南 变化真的好大! 如何搜索你所在领域的SCI杂志及排名? |
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